Curso de Profundización en Genética – 2011
Sección Genética Evolutiva – Facultad de Ciencias
- Docentes Responsables: Dres. Ruben Pérez & Yanina Panzera
- Docentes Participantes: Mg. Lucía Calleros, Lic. Martín Hernández, Lic. Gregorio Iraola,
- Lic. Ana Marandino, Lic. Nicolás Sarute & Lic. Gonzalo Tomás
- Duración del curso: 26/04/2011 al 23/06/2011
- Horario: Martes y Jueves de 15 a 17:30 hrs.
TEÓRICOS
Variabilidad genética y microorganismos
- Relevamiento de la variabilidad genética. Metodologías de análisis de la variabilidad basadasen la identificación de ácidos nucleicos. Técnicas de amplificación y caracterización (PCR, RT-PCR, RFLP y secuenciación). Técnicas de Real Time PCR.
Genomas virales
- Generación de la variabilidad en virus. Mutación, recombinación y reordenamientos de segmentos genómicos. Sistemas de cuasiespecies.
- Genomas virales simples. El parvovirus canino. Genes estructurales y no-estructurales.
- Expresión del genoma. Origen y evolución. Análisis de la variabilidad.
- Virus Distemper canino. Organización genómica. Evolución por mutación y recombinación.
- Determinantes antigénicos. Análisis de la variabilidad (genes marcadores).
- Virus de la bronquitis aviar. Organización genómica. Análisis de la variabilidad mediante secuenciación y RFLP.
- Virus de gumboro. Organización genómica. Cepas clásicas, variantes e hipervirulentas.
- Reordenamientos genómicos. Análisis de la variabilidad mediante RFLP y Real Time PCR.
Genomas bacterianos
- Características generales de los genomas bacterianos. Variabilidad en la organización de sus componentes.
- Niveles de variabilidad en distintas regiones del genoma. Tipos de secuencias de los genomas bacterianos. Ejemplos de marcadores utilizados para analizar la variabilidad con diferentes objetivos (análisis evolutivos, ecológicos, epidemiológicos).
PRÁCTICOS INFORMÁTICOS
- Herramientas informáticas básicas para el análisis de secuencias. BLAST, alineamiento de secuencias. Bases de datos de virus y bacterias (VIPR, GOLD, IMG).
- Análisis y comparación de secuencias nucleotídicas y aminoacídicas.
- Diseño de un sistema de RFLP.
- Ensamblado de un genoma viral simple.
- Anotación del genoma parcial de una bacteria utilizando Artemis. Ejemplo en Campylobacter.
- Comparación de genomas bacterianos por BLAST y visualizados mediante ACT.
PRÁCTICOS DE LABORATORIO
- Amplificación mediante PCR y ensayo de RFLP para distinguir variantes virales.
- Diferenciación de subspecies de C. fetus mediante múltiplex PCR
SEMINARIOS
- Presentación y discusión de resultados obtenidos por los estudiantes
APROBACIÓN DEL CURSO
- 75% de asistencia a las clases teóricas
- 85 % de asistencia a las actividades prácticas
- Examen final: evaluación escrita individual.
CARGA HORARIA
- Aproximadamente 50 hs de clases teóricas, prácticas y seminarios.
CUPO
- Las clases prácticas tienen un cupo de 20 personas
CONSULTAS
- Dr. Ruben Pérez (rperez@fcien.edu.uy)
- Dra.Yanina Panzera (ypanzera@fcien.edu.uy)