Análisis de la variabilidad genética en microorganismos

Análisis de la variabilidad genética en microorganismos

Curso PEDECIBA – 2013

Docentes Responsables: Dres. Ruben Pérez & Yanina Panzera

Docentes Participantes: Mg. Lucía Calleros, Lic. Martín Hernández, Lic. Gregorio Iraola, Lic. Ana Marandino, Mg. Nicolás Sarute & Lic. Gonzalo Tomás

Duración del curso: 08 de abril al 12 de junio de 2013

Horario: lunes y miércoles de 15 a 18:30 hrs.

Inscripción: Bedelía Facultad de Ciencias hasta el 4 de abril.

Este curso puede ser tomado como curso de profundización (Lic. en Ciencias Biológicas).

PROGRAMA

Variabilidad genética en los microorganismos. Diversidad de los genomas virales y bacterianos. Mecanismo de generación de variabilidad. (Teórico).

Relevamiento de la variabilidad genética y sus metodologías de análisis (PCR, RT-PCR, RFLP, Real Time PCR y secuenciación). (Teórico).

Estudios en parvovirus canino (CPV). Variabilidad genética por mutación. Tasas de mutación. Cambios sinónimos y no-sinónimos. (Teórico).

Herramientas informáticas básicas para el análisis y comparación de secuencias nucleotídicas y aminoacídicas. Edición, ensamblado BLAST, alineamiento de secuencias. (Práctico informático).

Tasas de sustitución nucleotídica. Selección del modelo de sustitución. Teoría de Coalescencia (Práctico informático).

Estudios en el virus de la bronquitis aviar (IBV). Variabilidad genética por recombinación. (Teórico). Lunes 29/04

Estudios en el virus de la bursitis infecciosa aviar (IBDV). Variabilidad genética por reordenamientos de segmentos genómicos. (Teórico).

Identificación de cepas recombinantes en IBV (Práctico informático).

PCR múltiplex y RFLP para detectar cepas con genomas reordenados de IBDV. (Práctico de laboratorio).

Estudios en el virus distemper canino (CDV).Variabilidad genética en las poblaciones virales por cuasiespecies. (Teórico).

Análisis de cuasiespecies. Métodos de secuenciación masiva. Estimación de la frecuencia de mutación. (Práctico informático).

Estudios genómicos en el género Campylobacter. Comparación de genomas completos. Organización y variabilidad de los componentes genómicos. (Teórico).

Estudios en Campylobacter fetus. Niveles de variabilidad genética en distintas regiones del genoma y uso de marcadores para el análisis de su variabilidad. (Teórico).

Comparación de genomas bacterianos. (Práctico informático).

Metodologías de PCR a tiempo real para la diferenciación de variantes genéticas.Amplificación mediante PCR a tiempo real para diferenciación de especies deCampylobacter. (Práctico de laboratorio).

Presentación de trabajos (Seminarios a cargo de los estudiantes).

Total horas dictadas: 60 hs

 

CONSULTAS

  • Dr. Ruben Pérez (rperez@fcien.edu.uy)
  • Dra.Yanina Panzera (ypanzera@fcien.edu.uy)

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