Coordinadora: Dra. Graciela García
Martes y jueves: 15-17:30 hs.
Salón de teórico: Salón 209
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Módulo I. Organización y función del genoma
Docentes participantes: Dr. Rúben Pérez, Dra. Gabriela Bedó, Dra. Yanina Panzera, Dra. Adriana Parodi
TEÓRICOS
13/04 Organización genómica I. Concepto de genoma. Variación del valor C y G (número de genes). Tipos de secuencias. Evolución de secuencias exónicas e intrónicas. Origen de los genes por duplicación. R. Pérez
15/04 Organización genómica II. Elementos transponibles: clasificación, evolución y efectos en el genoma hospedero. Secuencias satélite: micro, mini y macro satélites. Y. Panzera
20/04 Estrategias de estudio de genomas completos. Técnicas de secuenciación. Estrategias de secuenciación a gran escala. Ensamblado y mapeo de genomas. Análisis de secuencias. G. Bedó
22/04 Análisis de la función del gen. Genética inversa. Uso de transgénicos y ARN interferente. Análisis de la expresión génica (Transcriptoma y Proteoma). A. Parodi.
PRÁCTICOS
Actividades de bioinformática y laboratorio (R.Pérez, Y. Panzera, G.Bedó, A. Parodi).
- Herramientas informáticas para el análisis de los genomas. Ensamblado, anotación y comparación de genomas. Ejemplos de genomas de virus, bacterias y eucariotas. 2 clases. Salones de informática.
Prácticos de informática (primera parte)
- Amplificación por PCR de un genoma viral. Ensamblado, anotación y análisis de variantes. Análisis a nivel de ARN y proteínas. 3 clases. Salones de informática y laboratorios (5º piso).
Módulo II. Introducción a la organización del genoma eucariota mediante estrategias genéticas de mapeo.(*)
Docentes participantes: Dra. Beatríz Goñi, Dra. Graciela García
(*)Algunas clases prácticas se dictarán durante el horario del curso en los salones indicados.
Protocolo práctico – Anexo – Bibliografía clases G. García. – Teoricos B.Goñi
Teórico – Introducción a los diferentes tipos de mapeo: genético, citogenético y físico. Marcadores fenotípicos-moleculares en la construcción de mapas genéticos. Diseños experimentales y tipos de cruzamientos. Caracteres discretos (o cualitativos). G. García
Práctico – Recombinación en Drosophila. Prueba de 3 puntos (I). Introducción y 1er cruzamiento (salón 306). B. Goñi
Teórico – Recombinación y mapeo genético en Drosophila melanogaster. Modificadores de la recombinación. B. Goñi
Teórico – Introducción a los cromosomas politénicos y su aplicación en el mapeo citogenético y estudios evolutivos. B. Goñi
Práctico – Recombinación en Drosophila. Prueba de 3 puntos (II). Observación progenie F1 y 2do cruzamiento (salón 306). B. Goñi
Práctico – Cromosomas politénicos (I). Disección glándulas salivares en Drosophila (salón 306). B. Goñi
Práctico – Cromosomas politénicos (II). Técnica del aplastado para observar los cromosomas gigantes en Drosophila spp. (salón 306). B. Goñi
Práctico – Cromosomas politénicos (III). Identificación de los cromosomas. Observación de reordenamientos cromosómicos. Utilización del citomapa. (salón 306). B. Goñi
Teórico – Mapas de ligamiento y asociación utilizando marcadores moleculares. Mapeo genómico de alta densidad. Herramientas estadísticas y de genética poblacional en el mapeo. G. García
Práctico – Recombinación en Drosophila. Prueba de 3 puntos (III). Observación de la progenie F2. Determinación orden de los genes. Calculo de distancias genéticas. Discusión de los resultados. (salón 306). B. Goñi
Teórico- Mapeo de caracteres continuos (o cuantitativos) y rasgos de arquitectura compleja- QTLs (Quantitative Trait Loci). Aproximaciones al mapeo utilizando GWAS (Genome-Wide Association Studies). G. García
Teórico – Integración entre mapas genéticos, citogenéticos y físicos. G. García
Prácticos – Construcción de mapas genómicos de alta densidad utilizando marcadores moleculares. Utilización de programas computacionales en la construcción de grupos de ligamiento. (salón a confirmar). G.García
Seminario I - B. Goñi
Seminarios II – G. García
MODALIDAD DEL CURSO:
10 Clases teóricas (25 hs)
Prácticos (30 hs)
Seminarios de presentación de la actividad práctica (5 hs)
Comienzo: 13 de abril de 2010
Duración: Un SEMESTRE. Total de horas estimadas: 60 hs
Aprobación:
- 75% de asistencia a las clases
- Asistencia a toda la actividad práctica y participación obligatoria en los Seminarios.
- Examen final: Evaluación escrita individual.